基因测试可以快速诊断出任何类型的感染

　　

　　研究人员称，一种尖端的基因测试可以快速检测和识别人体内几乎任何一种致病微生物，无论是病毒、细菌、真菌还是寄生虫。

　　在加州大学旧金山分校（University of California-San Francisco）开发出这种基因测试后，医生们用它来识别脊髓液中的病原体已经有十多年了。

　　根据周二发表在《自然医学》（Nature Medicine）杂志上的一项新研究，现在研究人员已经对这种测试进行了改进，以识别呼吸道液体中可能导致肺炎的细菌。

　　该研究称，研究小组还实现了这项被称为宏基因组下一代测序（mNGS）的测试的自动化。

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　　研究人员表示，新的呼吸道版本的mNGS测试只需要30分钟的动手时间，机器人和人工智能就可以接管，并且可以及时返回结果，以治疗危险的感染。

　　“我们的目标是在12到24小时内完成整个过程，在同一天或第二天给出结果，”加州大学旧金山分校的实验室医学和传染病教授、高级研究员查尔斯·邱博士在新闻发布会上说。

　　mNGS测试采用赤手空拳的方法进行分析。

　　该测试不是逐个寻找单一类型的病原体，而是分析样本中存在的所有RNA和DNA，然后将人类遗传物质与源自细菌、病毒、真菌或寄生虫的遗传物质分离开来。

　　“我们的技术看起来很简单，”Chiu说。“通过用一项测试取代多项测试，我们可以在诊断和治疗感染时省去漫长的猜测工作。”

　　mNGS测试首次引起轰动是在2014年，当时医生用它挽救了当时15岁的约书亚·奥斯本（Joshua Osborn）的生命，他患有令人虚弱的头痛、发烧、体重减轻和疲劳。

　　奥斯本住在威斯康星州的Cottage Grove。他最终因患有危及生命的脑炎而陷入昏迷，但仍然没有人能弄清楚是什么让他生病的。医学检查和脑部活检都没发现什么

　　但一旦使用了mNGS，测试就在48小时内找出了原因。

　　它最终被发现是圣塔罗萨钩端螺旋体，一种原产于波多黎各的细菌。事实证明，奥斯本和他的家人在他住院前一年参观了那里的一个教堂营地。

　　这种病折磨了他一年多，最后的治疗方法是老式的盘尼西林。

　　“我很高兴能活着，”奥斯本当时说。“从百分比来看，我很可能不会成为总统。我心存感激。”

　　在2016年至2023年期间，加州大学旧金山分校的研究小组用这种测试分析了近5000份脊髓液样本，其中超过14%的样本被证明存在感染。

　　研究人员在他们的新论文中说，总体而言，该测试在86%的情况下准确地识别出脊髓液中的病原体。

　　“我们的mNGS测试比任何其他类型的神经系统感染测试都要好，”Chiu说，“结果支持它作为诊断设备的关键部分，用于治疗传染病患者的医生。”

　　基于这些结果，研究人员对该测试进行了调整，使其成为呼吸系统疾病的快速反应系统，而呼吸系统疾病可能成为下一次世界大流行的基础。

　　新报告显示，这种检测方法可以在不到一天的时间内检测出COVID、流感和RSV等呼吸道病毒，即使样本中只有少量病毒。

　　该测试还应该能够检测出未来可能出现的菌株。

　　脊髓液和呼吸液滴版本的mNGS测试都获得了美国食品和药物管理局的突破性设备指定，将它们置于全面批准的快速通道上。

　　更多的信息

　　美国微生物学会有更多关于下一代宏基因组测序的信息。

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